Manter dados no local

hosting

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Tenho um seguinte problema , de vez em quando minha hospedagem dá problema e quando volta os arquivos recentes que estão lá substitui o que estão na maquina local , isso é se tiver 3 pasta lá e 4 pasta aqui no local a quarta pasta no local é apagada e isso me prejudica porque a atual correta é que está aqui no local 4 pasta .. e lá só tem 3 porque a hospedagem por algum problema teve que restaurar um dia antes e perdeu arquivos e volta como tava antes só que eu estou com arquivo novos no local e ao inves de atualizar para o onwcloud ele faz ao contrário deixa oque tá la tambem no local apaga o atual do local.. como resolvo isso? para manter atualizado o local e fazer copia apaenas para as nuvens sem apagar o local e se caso apague alguma pasta lá na nuvem não apague no local e sim reponhe lá de volta nas nuvens.preciso dessa ajuda