Hi !
Yesterday i upgraded my owncloud server from 9.0 to 9.1 on Ubuntu inside hyper-v virtual machine. Everything went right. But then i tried to upgrade my Ubuntu itself from 14.04.1 to 16.04.1 LTS (pretty huge gap...) via apt-get update/upgrade and more than half of my owncloud server directory wiped from /var/www/owncloud.
Here is my owncloud folder on ubuntu 14 :
user@owncloud-hv:/var/www/owncloud$ ls -l
total 192
drwxr-xr-x 29 www-data www-data 4096 août 1 17:59 3rdparty
drwxr-xr-x 34 www-data www-data 4096 août 1 18:29 apps
drwxr-xr-x 2 www-data www-data 4096 mars 8 15:09 assets
-rw-r--r-- 1 root root 8301 juil. 20 11:15 AUTHORS
drwxrwxr-x 2 www-data www-data 4096 août 1 18:28 config
-rw-r--r-- 1 root root 3805 juil. 20 11:15 console.php
-rw-r--r-- 1 root root 34520 juil. 20 11:15 COPYING-AGPL
drwxr-xr-x 17 www-data www-data 4096 août 1 17:59 core
-rw-r--r-- 1 root root 5032 juil. 20 11:15 cron.php
drwxr-xr-x 2 www-data www-data 4096 août 2 15:40 data
-rw-r--r-- 1 root root 35830 juil. 20 11:15 db_structure.xml
drwxr-xr-x 2 www-data www-data 4096 mars 8 15:09 etc
-rw-r--r-- 1 root root 179 juil. 20 11:15 index.html
-rw-r--r-- 1 root root 2282 juil. 20 11:15 index.php
drwxr-xr-x 3 www-data www-data 4096 août 1 17:59 l10n
drwxr-xr-x 6 www-data www-data 4096 août 1 17:59 lib
-rwxr-xr-x 1 root root 283 juil. 20 11:15 occ
drwxr-xr-x 2 www-data www-data 4096 août 1 17:59 ocs
drwxr-xr-x 2 www-data www-data 4096 août 1 17:59 ocs-provider
-rw-r--r-- 1 root root 3086 juil. 20 11:15 public.php
-rw-r--r-- 1 root root 5428 juil. 20 11:15 remote.php
drwxr-xr-x 4 www-data www-data 4096 mars 14 18:15 resources
-rw-r--r-- 1 root root 26 juil. 20 11:15 robots.txt
drwxr-xr-x 12 www-data www-data 4096 août 1 17:59 settings
-rw-r--r-- 1 root root 1893 juil. 20 11:15 status.php
drwxr-xr-x 4 www-data www-data 4096 août 1 17:59 themes
drwxr-xr-x 7 www-data www-data 4096 août 1 17:59 updater
-rw-r--r-- 1 root root 234 juil. 20 11:15 version.php
After ubuntu update, only apps folder, core and two others were there (didn't note which one...)
Fortunately i did a snapshot of my VM before and was able to rollback... but, wtf happened ?
Do you guys have any idea on what could have happened ? Thanks for any help...