Hi,
das sollte eigentlich funktionieren. Du kannst ggf. mal Deinen Webserver auf Funktionalität testen (Siehe: How to compile and run litmus (on debian) for WebDAV tests ). Beim synchronisieren von android → oC werden z.B. andere HTTP Methoden verwendet als beim synchronisieren von oC → android.
Ansonsten kann ich auch nur DAVDroid empfehlen, das wird vom großteil der Benutzer verwendet und funktioniert ohne Probleme mit ownCloud.